Por serem animais filtradores, as esponjas são ótimas bioindicadores de qualidade da água. Além disso, os poríferos fazem simbiose com organismo fotossintéticos (zooxantelas - matriz amarelada ou cianobactérias - matriz verde, violeta, marrom). E servem de alimento para muitas teias alimentares. Geralmente estão associados com recifes de corais, abrigando grande diversidade de organismos marinhos.
As esponjas secretam várias substâncias químicas, e elas podem ter propriedades anti-inflamatórias, antibióticas e antitumorais, sendo usadas na produção de medicamentos. Além disso, desde os tempos antigos, o endoesqueleto de algumas esponjas tem importante valor comercial. Eles eram e ainda são usados como esponjas de banho.
A esponja Spongia Tosta contém substâncias antibióticas que ajudam no tratamento de doenças homeopáticas.
